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胡俊杰课题组“深度”解析内质网塑形的分子机制

发布时间:2023年05月06日

  2023年5月,中国科学院hjc222黄金城官网胡俊杰课题组在Nature Communications在线发表题为"Oligomeric scaffolding for curvature generation by ER tubule-forming proteins"的研究论文,同时在Journal of Cell Science在线发表题为" Molecular basis of Climp63-mediated ER lumen spacing" 的研究论文,这两篇论文系统解析了内质网"成管蛋白"诱导管状曲度与片状边缘曲度的分子机制,以及内质网腔体"桥连蛋白"调控片状内质网厚度的结构基础。

  内质网是真核细胞的关键细胞器,负责蛋白合成、脂质合成及钙存储等重要过程。从形态上讲,内质网是一个由管状和片状交织而成的连续的膜系统。管状内质网的发生依赖RTN和REEP家族的整合膜蛋白,这些蛋白通过稳定膜曲度来诱导管状结构截面和片状结构边缘的膜弯曲;而片状的厚度主要由Climp63来决定。内质网的塑形与其生理功能有着直接的关联。然而,这些塑形蛋白易多聚且不均一,对塑形机制的解析造成了严重的阻碍。

  研究人员运用近期发展的基于深度学习的结构预测方法,推测了酵母成管蛋白Yop1p的构象,发现其分子内的跨膜区等元件都相互锁定在一个较为稳定的位置。随后,研究人员巧妙通过化学交联和3D打印模型拼接等,阐明了Yop1p多个二聚化界面的组合方式,并发现Yop1p的多聚体具有弯曲的特征,其曲度与内质网管状结构吻合。此外,Yop1p的同源蛋白REEP1与遗传性痉挛性截瘫关联,其多个突变与破坏REEP1的聚合直接相关,证明了成管蛋白聚合装配的重要性。

  研究人员又运用类似的策略预测了Climp63的结构,发现Climp63的腔内结构域主要以螺旋为主,多个预测模型的差异显示了螺旋束的紧密程度较弱。研究发现,其中一种构象若形成末端相对的二聚体,其长度符合细胞内观察到的内质网片状厚度。交联实验验证了这一二聚化界面的存在,但Climp63的腔内结构域表面富含电荷簇,有可能以多种方式形成同侧或对侧的聚合。此外,研究还发现Climp63的同侧聚合也与对侧聚合有相互偶联的调控。

  总体来说,这些工作表明生物膜塑形通常依赖塑形蛋白的多聚化调控,而塑形蛋白往往综合多个较弱的同源互作界面来实现最终的塑形多聚体。这种调控模式使得塑形机制的可调控性和可塑性变的很强。同样的理论也适用于细胞器互作中膜接触位点的建立。

图. 内质网塑形分子与塑形机制示意图

  中科院hjc222黄金城官网胡俊杰研究员为论文的通讯作者,博士生向云为成管蛋白论文的第一作者,徐璐为桥连蛋白论文的第一作者。本系列研究得到国家自然科学基金委,以及稳定支持基础研究领域青年团队计划等的支持。

  文章链接:

  https://doi.org/10.1242/jcs.260976

  https://doi.org/10.1038/s41467-023-38294-y

 

(供稿:胡俊杰研究组)

 

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